水资源对于农田而言是非常重要的，水利工程对于农业发展有着十分积极的作用。但是这些水利工程在建设和管理过程中存在着较多的问题，例如小型农田水利工程管理体系落后、小型农田水利工程管理随意以及小型农田水利工程建设资金缺乏，下面将对这三种小型农田水利工程建设和管理的问题进行详述。
1小型农田水利工程管理体系落后
农民在长期的用水过程中更多注重的是自身的经济效益，没有考虑到集体的经济效益，即没有人愿意对小型农田水利工程建设进行管理，只是想一味的去用水。这主要是由于管理体系的问题，政府也很难管理农田水利工程的建设。另外有的地方政府组织农民修建农田水利工程，但是修建后的水利工程没有发挥其作用，水利工程的修建只是一个摆设，不少农田水利工程出现了堵塞以及破裂的现象，但是没有人组织进行修理，这种情况长时间发展会导致农田水利工程出现淤泥、杂草以及垃圾，无法实现农田水利工程修建的目标。出现这种现象主要是由于农民的思维局限性，因为其更多注重的是眼前利益，而没有考虑到以后的发展趋势，同时也无法克服自然灾害给农田带来的损失。还有不少农田水利工程经过长时间的使用已经失去使用价值，但是却没有进行翻修，政府没有倡导进行翻修，农民也就没想翻修，水利工程管理意识十分缺乏。
2小型农田水利工程管理随意、不彻底
我国大多数农田水利工程都是由于管理随意而导致损坏的，在进行农田水利工程施工时没有切实的考虑其影响因素，例如水利工程的尺寸以及厚度都没有进行严格的考察，只是简单的进行管理。有的水利工程在出现损坏的情况之后，维修人员只是简单的将漏洞修补，而没有考虑漏洞产生的原因，这样的话漏洞还是会再次出现。这主要是由于小型农田水利工程的管理缺乏科学指导依据，乡下政府只是为了完成中央下达的任务，而没有切实的将小型农田水利工程的修建落到实处，有些乡下政府为了谋求更多的中央拨款就对水利工程的建设偷工减料，没有按照国家正规的标准去建设。有的乡下政府虽然没有挪用中央拨款，但是水利工程建设单位却为了自己的利益而没有严格按照标准进行建设，这样所导致的后果是水利工程的质量非常差，农民根本无法用到水利工程进行田间灌溉。
3小型农田水利工程建设资金缺乏
由于我国是一个农业大国，农田面积非常大，国家的财政拨款有限，所以分配到乡下政府的水利工程建设资金较少，资金较少的情况下是无法进行水利工程修建的，因为农田水利工程需要的建造面积非常大，所使用的生产材料也较少，人工费用较高，这没有足够的资金是无法进行建设的。国家财政拨款只够维持部分的水利工程建设，建设单位无法获取相应的利润就不愿意接手这样的工程。如果在修建资金不足的情况下进行修建通常会使得工程无法顺利竣工，而且使得水利工程的建设周期显著延长，在长时间的等待过程中修建好的水利工程也要进行相应的翻修，这样所需要的修建资金会更多。现今的工程周期是由工程资金所决定的，工程资金越多工程休假周期越短，因此我国水利工程的建设周期是十分缓慢的，农村经济发展也止步不前。
4小型农田水利工程施工难度大
我国的农田大多是分散的，大面积聚集在一起的农田十分少，所以在进行农田水利工程施工时非常麻烦。如果农田大面积的聚集在一起，那么所需要修建的小型农田水利工程就越少，所需要的工程资金就越少。由于我国的农田大多分散分布，为了使得每一块农田都能加入到水利工程当中，所需要的施工工作量就越大，况且我国的地势高低起伏、高度落差较大，很难进行施工，而且在大坡度的农田中地势低的水是很难流向地势较高的，往往要在设计过程中添加多种辅助工具，这样才能够使得小型农田水利工程更加全面的为农民带来好处，帮助农民获取较大的经济效益。
